Wedi'i adeiladu ar lethrau'r bryniau, roedd yn rhaid i strwythur trefol y ddinas hon addasu i agweddau topograffig y tir, er ei fod yn ceisio parchu siâp reticular fel bwrdd gwyddbwyll.
Yn y tymor hir, caniataodd yr agwedd hon iddo dyfu mewn ffordd bwyllog a chytûn, sydd dros y canrifoedd wedi cadw ei gymeriad gwreiddiol. Cododd ei sylfaen o'r angen i amddiffyn a diogelu teithwyr a oedd yn cludo rhwng Zacatecas a phrifddinas teyrnas Sbaen Newydd ar y pryd, gan gludo mwynau yn bennaf ac a oedd dan warchae gan nomadiaid brodorol cenedl Chichimeca Tua'r flwyddyn 1542, Fray Juan de Sefydlodd San Miguel yng nghyffiniau'r ddinas bresennol dref gyda'r enw Itzcuinapan, gan gysegru'r Archangel San Miguel fel nawddsant. Cafodd y boblogaeth gyntefig honno broblemau difrifol gyda’r cyflenwad dŵr, yn ychwanegol at ymosodiadau parhaus a threisgar Chichimecas brodorol y rhanbarthau cyfagos. Am y rheswm hwn, symudodd trigolion y Villa de San Miguel yr anheddiad ychydig gilometrau i'r gogledd-ddwyrain; dyna'r man lle yn 1555, ar gais y ficeroy Don Luis de Velasco, y byddai'r Villa de San Miguel el Grande yn cael ei sefydlu gan Don Ángel de Villafañe. Roedd y ficeroy hefyd yn mynnu bod cymdogion Sbaen yn ymgartrefu yno a fyddai’n cael tir a da byw, tra byddai’r bobl frodorol a oedd yn byw ynddo yn cael maddeuant ac yn cael eu llywodraethu gan eu penaethiaid eu hunain i osgoi gwrthryfeloedd yn y dyfodol.
Ar Fawrth 8, 1826, gwnaeth Cyngres y Wladwriaeth ei bod yn ddinas a newid ei henw, a fyddai o hyn ymlaen yn San Miguel de Allende, er anrhydedd i'r gwrthryfelwr enwog a anwyd yno ym 1779.
Y tu mewn i'r ddelwedd drefedigaethol ddeniadol hon, mae sawl palas gwirioneddol ryfeddol ar y pryd yn cael eu cartrefu. Ymhlith y rhai mwyaf rhagorol mae'r Palas Bwrdeistrefol, neuadd y dref gynt a adeiladwyd ym 1736. Y tŷ lle ganwyd Ignacio Allende, enghraifft o bensaernïaeth Baróc y ddinas, yn enwedig ar ei ffasâd, ac sydd ar hyn o bryd yn Amgueddfa Ranbarthol. Cwblhawyd Camlas Casa del Mayorazgo de la, gyda ffasâd neoglasurol hardd, tua diwedd y 18fed ganrif gan José Mariano de la Canal y Hervas, henadur, deon ac ymlyniad brenhinol. Hen faenordy Don Manuel T. de la Canal, adeiladwaith ym 1735 a gafodd ei adnewyddu yn ôl prosiect gan y pensaer enwog o Sbaen, Don Manuel Tolsá ym 1809; ar hyn o bryd mae'r adeilad yn gartref i Sefydliad Allende ac mae'n tynnu sylw at ehangder ei gyrtiau mewnol, capel hardd a'i fwâu rhyfeddol. Tŷ'r Ymholwr, a wasanaethodd fel preswylfa comisiynydd y Swyddfa Sanctaidd ac sy'n dyddio o 1780. Tŷ'r Marqués de Jaral de Berrio, a adeiladwyd ar ddiwedd y 18fed ganrif, a Thŷ Cyfrifau Loja gyda'i ffasâd cain.
O ran pensaernïaeth grefyddol, mae gan y ddinas hefyd drysorau pensaernïol o werth rhyfeddol, fel eglwys a lleiandy Santo Domingo, adeilad sobr o 1737. Lleiandy Leal de la Concepción, sef y Ganolfan Ddiwylliannol ar hyn o bryd, Mae'n adeilad rhyfeddol ar gyfer ei batio enfawr; Fe'i hadeiladwyd yn y 18fed ganrif gan y pensaer Francisco Martínez Gudlño.
Capel y Santa Cruz del Chorro, un o'r hynaf; teml y Trydydd Gorchymyn, yn dyddio o ddechrau'r ail ganrif ar bymtheg. Cymhleth hardd teml ac areithyddiaeth San Felipe Neri, o ddechrau'r 18fed ganrif; mae gan yr eglwys ffasâd baróc afieithus wedi'i wneud mewn chwarel binc a chydag addurniad o ddylanwad cynhenid cryf. Mae gan ei du mewn addurn amrywiol a chyfoethog rhwng dodrefn, cerfluniau a phaentiadau sy'n haeddu edmygedd, yn ychwanegol at gapel ysblennydd y Santa Casa de Loreto a'i Camarín de la Virgen, y ddau wedi'u haddurno'n goeth ac sydd oherwydd defosiwn y Marquis Manuel Camlas Tomás de la. Ger yr areithfa mae teml Our Lady of Health, a adeiladwyd yn y 18fed ganrif gyda'i ffasâd cilfachog wedi'i goroni â chragen fawr.
Hefyd ymhlith y rhai mwyaf deniadol yn y ddinas, mae teml San Francisco, o'r 18fed ganrif, gyda'i ffasâd hardd Churrigueresque, ac mae'r plwyf enwog bron yn symbol o San Miguel de Allende; Er bod ei hadeiladwaith arddull neo-gothig yn fwy diweddar, fe'i hadeiladwyd ar strwythur yr hen deml o'r 17eg ganrif, gan barchu ei thu mewn a'i gynllun gwreiddiol yn llawn.
Yn agos iawn at y ddinas mae cysegr Atotonilco, adeiladwaith o'r 13eg ganrif o gyfrannau sobr sy'n edrych fel caer a thu mewn y mae paentiadau gwerthfawr o'r un ganrif yn cael eu cadw.
